Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EFHC1Q5JVL4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
EFHC1Q5JVL4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EFHC1Q5JVL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHC1Q5JVL4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms