Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC38Q502W7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC38Q502W7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC38Q502W7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC38Q502W7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms