Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDO1Q16878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDO1Q16878 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDO1Q16878 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDO1Q16878 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDO1Q16878 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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