Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF239Q16600 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF239Q16600 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF239Q16600 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF239Q16600 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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