Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSHL1Q14406 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSHL1Q14406 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSHL1Q14406 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSHL1Q14406 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSHL1Q14406 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSHL1Q14406 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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