Protein–RNA interactions for Protein: Q14137

BOP1, Ribosome biogenesis protein BOP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOP1Q14137 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BOP1Q14137 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BOP1Q14137 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BOP1Q14137 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BOP1Q14137 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms