Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMB3Q13751 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMB3Q13751 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMB3Q13751 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMB3Q13751 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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