Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB3BPQ13352 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB3BPQ13352 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB3BPQ13352 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB3BPQ13352 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms