Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHAF1AQ13111 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1AQ13111 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHAF1AQ13111 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHAF1AQ13111 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms