Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POU3F1Q03052 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POU3F1Q03052 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F1Q03052 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.9 ms