Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
APBA1Q02410 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
APBA1Q02410 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APBA1Q02410 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms