Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PITX1P78337 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PITX1P78337 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PITX1P78337 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PITX1P78337 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PITX1P78337 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITX1P78337 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PITX1P78337 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITX1P78337 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITX1P78337 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITX1P78337 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PITX1P78337 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PITX1P78337 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PITX1P78337 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITX1P78337 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITX1P78337 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PITX1P78337 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PITX1P78337 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PITX1P78337 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITX1P78337 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PITX1P78337 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PITX1P78337 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITX1P78337 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITX1P78337 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITX1P78337 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITX1P78337 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PITX1P78337 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PITX1P78337 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITX1P78337 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PITX1P78337 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITX1P78337 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITX1P78337 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITX1P78337 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITX1P78337 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITX1P78337 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PITX1P78337 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX1P78337 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITX1P78337 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITX1P78337 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITX1P78337 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITX1P78337 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITX1P78337 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX1P78337 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITX1P78337 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITX1P78337 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITX1P78337 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PITX1P78337 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX1P78337 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX1P78337 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX1P78337 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX1P78337 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX1P78337 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITX1P78337 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITX1P78337 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITX1P78337 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITX1P78337 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITX1P78337 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITX1P78337 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITX1P78337 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX1P78337 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX1P78337 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX1P78337 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITX1P78337 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITX1P78337 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITX1P78337 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITX1P78337 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITX1P78337 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITX1P78337 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITX1P78337 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX1P78337 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms