Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERVK_113P63132 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113P63132 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERVK_113P63132 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms