Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1CAP62136 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1CAP62136 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1CAP62136 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1CAP62136 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms