Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCCD1P59942 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCCD1P59942 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCCD1P59942 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCCD1P59942 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCCD1P59942 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms