Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00205P59089 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00205P59089 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00205P59089 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms