Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD2BP57060 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD2BP57060 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD2BP57060 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD2BP57060 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms