Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN18P56856 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN18P56856 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN18P56856 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms