Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUMO3P55854 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUMO3P55854 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUMO3P55854 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUMO3P55854 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2208.9 ms