Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB1P54762 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB1P54762 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB1P54762 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms