Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC3P53804 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC3P53804 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC3P53804 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC3P53804 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC3P53804 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC3P53804 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC3P53804 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC3P53804 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC3P53804 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC3P53804 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC3P53804 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC3P53804 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC3P53804 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC3P53804 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC3P53804 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC3P53804 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC3P53804 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC3P53804 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC3P53804 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC3P53804 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC3P53804 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC3P53804 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC3P53804 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC3P53804 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC3P53804 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC3P53804 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC3P53804 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC3P53804 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC3P53804 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC3P53804 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTC3P53804 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC3P53804 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC3P53804 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC3P53804 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC3P53804 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC3P53804 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC3P53804 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC3P53804 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC3P53804 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC3P53804 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC3P53804 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC3P53804 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC3P53804 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC3P53804 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC3P53804 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC3P53804 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC3P53804 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC3P53804 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC3P53804 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC3P53804 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC3P53804 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC3P53804 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC3P53804 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC3P53804 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms