Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC3P51654 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC3P51654 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC3P51654 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC3P51654 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC3P51654 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC3P51654 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC3P51654 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC3P51654 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC3P51654 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC3P51654 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC3P51654 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC3P51654 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC3P51654 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC3P51654 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC3P51654 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC3P51654 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC3P51654 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC3P51654 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC3P51654 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC3P51654 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC3P51654 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC3P51654 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC3P51654 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC3P51654 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPC3P51654 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC3P51654 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC3P51654 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC3P51654 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC3P51654 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC3P51654 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC3P51654 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC3P51654 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC3P51654 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC3P51654 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC3P51654 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC3P51654 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC3P51654 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC3P51654 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC3P51654 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC3P51654 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC3P51654 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC3P51654 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC3P51654 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC3P51654 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC3P51654 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC3P51654 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC3P51654 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms