Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRP3P50461 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP3P50461 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP3P50461 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 421.7 ms