Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC10P48553 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC10P48553 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC10P48553 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC10P48553 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms