Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALDH1A3P47895 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A3P47895 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALDH1A3P47895 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A3P47895 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms