Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GARSP41250 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GARSP41250 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GARSP41250 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GARSP41250 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARSP41250 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARSP41250 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARSP41250 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARSP41250 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GARSP41250 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARSP41250 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARSP41250 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARSP41250 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GARSP41250 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARSP41250 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARSP41250 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARSP41250 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARSP41250 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GARSP41250 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARSP41250 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARSP41250 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARSP41250 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GARSP41250 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GARSP41250 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GARSP41250 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GARSP41250 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GARSP41250 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARSP41250 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GARSP41250 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GARSP41250 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARSP41250 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARSP41250 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARSP41250 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARSP41250 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GARSP41250 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARSP41250 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARSP41250 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GARSP41250 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GARSP41250 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GARSP41250 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GARSP41250 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GARSP41250 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GARSP41250 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GARSP41250 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GARSP41250 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GARSP41250 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARSP41250 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARSP41250 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARSP41250 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GARSP41250 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARSP41250 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARSP41250 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARSP41250 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARSP41250 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GARSP41250 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GARSP41250 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GARSP41250 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARSP41250 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARSP41250 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARSP41250 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARSP41250 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GARSP41250 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms