Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNFP41002 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNFP41002 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNFP41002 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNFP41002 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNFP41002 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNFP41002 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNFP41002 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNFP41002 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNFP41002 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNFP41002 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNFP41002 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNFP41002 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNFP41002 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNFP41002 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNFP41002 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNFP41002 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNFP41002 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNFP41002 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNFP41002 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNFP41002 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNFP41002 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNFP41002 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNFP41002 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNFP41002 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNFP41002 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNFP41002 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNFP41002 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNFP41002 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNFP41002 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNFP41002 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNFP41002 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNFP41002 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNFP41002 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNFP41002 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNFP41002 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNFP41002 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNFP41002 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNFP41002 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNFP41002 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNFP41002 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNFP41002 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNFP41002 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms