Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNA7P36544 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNA7P36544 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms