Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR7P32248 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR7P32248 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR7P32248 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR7P32248 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR7P32248 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR7P32248 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR7P32248 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR7P32248 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR7P32248 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR7P32248 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR7P32248 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR7P32248 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR7P32248 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR7P32248 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR7P32248 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR7P32248 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR7P32248 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR7P32248 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR7P32248 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR7P32248 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR7P32248 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR7P32248 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR7P32248 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR7P32248 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR7P32248 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR7P32248 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR7P32248 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR7P32248 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR7P32248 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR7P32248 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR7P32248 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR7P32248 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR7P32248 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR7P32248 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR7P32248 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR7P32248 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR7P32248 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR7P32248 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR7P32248 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR7P32248 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR7P32248 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR7P32248 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR7P32248 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR7P32248 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR7P32248 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR7P32248 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR7P32248 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms