Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC12P31275 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXC12P31275 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXC12P31275 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC12P31275 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms