Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA3P25788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA3P25788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMA3P25788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMA3P25788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms