Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CXCR2P25025 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR2P25025 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR2P25025 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CXCR2P25025 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms