Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCB4P21439 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCB4P21439 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCB4P21439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms