Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR1P18146 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EGR1P18146 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EGR1P18146 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EGR1P18146 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR1P18146 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR1P18146 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EGR1P18146 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EGR1P18146 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EGR1P18146 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EGR1P18146 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EGR1P18146 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR1P18146 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR1P18146 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR1P18146 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR1P18146 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EGR1P18146 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR1P18146 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR1P18146 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR1P18146 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR1P18146 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EGR1P18146 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EGR1P18146 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EGR1P18146 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR1P18146 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR1P18146 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR1P18146 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EGR1P18146 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EGR1P18146 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EGR1P18146 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR1P18146 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR1P18146 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR1P18146 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EGR1P18146 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR1P18146 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR1P18146 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR1P18146 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR1P18146 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EGR1P18146 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms