Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR23D2P0DMB1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRR23D2P0DMB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRR23D2P0DMB1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR23D2P0DMB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR23D2P0DMB1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRR23D2P0DMB1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms