Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF888P0CJ79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF888P0CJ79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF888P0CJ79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF888P0CJ79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms