Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBBP0CG47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBBP0CG47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBBP0CG47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 665.2 ms