Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTXN2P0C2S0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTXN2P0C2S0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTXN2P0C2S0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms