Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV3-11P04433 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV3-11P04433 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV3-11P04433 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IGKV3-11P04433 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms