Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABARAPO95166 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPO95166 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPO95166 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms