Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATBO75879 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATBO75879 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATBO75879 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATBO75879 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATBO75879 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATBO75879 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATBO75879 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATBO75879 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATBO75879 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATBO75879 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATBO75879 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATBO75879 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATBO75879 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATBO75879 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATBO75879 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATBO75879 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATBO75879 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATBO75879 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATBO75879 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATBO75879 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATBO75879 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATBO75879 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATBO75879 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATBO75879 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GATBO75879 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GATBO75879 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GATBO75879 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATBO75879 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATBO75879 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATBO75879 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATBO75879 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GATBO75879 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATBO75879 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATBO75879 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATBO75879 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATBO75879 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATBO75879 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATBO75879 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATBO75879 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms