Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPB7O75200 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPIPB7O75200 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPIPB7O75200 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB7O75200 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB7O75200 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NPIPB7O75200 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB7O75200 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPIPB7O75200 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms