Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMARCA5O60264 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA5O60264 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SMARCA5O60264 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMARCA5O60264 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMARCA5O60264 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms