Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5O60239 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP5O60239 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5O60239 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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