Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPTLC2O15270 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTLC2O15270 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTLC2O15270 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTLC2O15270 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms