Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC27A2O14975 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC27A2O14975 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC27A2O14975 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC27A2O14975 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms