Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDC80O14777 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDC80O14777 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDC80O14777 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDC80O14777 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC80O14777 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC80O14777 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC80O14777 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDC80O14777 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDC80O14777 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NDC80O14777 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDC80O14777 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDC80O14777 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDC80O14777 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDC80O14777 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC80O14777 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC80O14777 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC80O14777 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDC80O14777 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDC80O14777 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDC80O14777 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDC80O14777 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC80O14777 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC80O14777 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC80O14777 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC80O14777 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDC80O14777 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC80O14777 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC80O14777 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC80O14777 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC80O14777 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDC80O14777 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDC80O14777 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC80O14777 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC80O14777 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC80O14777 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC80O14777 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDC80O14777 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC80O14777 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC80O14777 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDC80O14777 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDC80O14777 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDC80O14777 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC80O14777 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC80O14777 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC80O14777 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC80O14777 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDC80O14777 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDC80O14777 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms