Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB9F8W1W9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB9F8W1W9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB9F8W1W9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB9F8W1W9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms