Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PP2D1A8MPX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PP2D1A8MPX8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PP2D1A8MPX8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PP2D1A8MPX8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms