Protein–RNA interactions for Protein: A6NLI5

TRIM64C, Putative tripartite motif-containing protein 64C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64CA6NLI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM64CA6NLI5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM64CA6NLI5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM64CA6NLI5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM64CA6NLI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms